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11月8日周日
  1. iNature30

    Biomaterials | 广州医科大学周蕾等设计甘草酸可注射ROS响应水凝胶缓解神经病理性疼痛

    广州医科大学周蕾等设计了一种ROS响应性天然药物自递送水凝胶GPG(GA-PBA-GA),用于神经病理性疼痛的局部持续治疗。机制引导的虚拟筛选鉴定甘草酸(GA)为PI3K靶向候选分子,体外实验显示GPG可抑制PI3K-Akt信号并促进巨噬细胞M1向M2再极化。在大鼠L5脊神经结扎模型中,DRG周围给药减轻机械性与热痛觉过敏,改善步态与电生理功能,并减少DRG神经炎症与脊髓小胶质细胞活化。

10月30日周五
  1. 药化猩球58

    能结合却无药效的分子还能做什么:从沉默结合到PROTAC与RiboTAC的药化设计

    作者费米子父梳理了沉默结合配体在诱导邻近技术中的再利用路径,涵盖SAR by catalog、RiboTAC、RNATAC、RIPTAC与PhosTAC。文中引用Disney团队2023年Nature研究,将结合RNA但无功能效应的小分子接上RNase L招募模块后成为降解剂;Tong等2024年全转录组研究中481个结合RNA靶标仅5个达到RNase L依赖切割标准。

    推荐理由:文章把沉默结合配体与多种诱导邻近技术串成一套设计检查框架,便于理解配体再利用的取舍。

5月15日周五
  1. AI4Protein67

    清华与字节团队AnewOmni:跨尺度统一分子生成模型

    字节AI制药团队与清华AIR团队开发统一分子生成模型AnewOmni,可设计小分子、多肽和纳米抗体,训练数据超过500万个生物分子复合物。模型支持可编程图提示,可施加化学约束、拓扑约束与几何转向,并生成非天然氨基酸、手性分子、共价结合等非标准化学结构。

    推荐理由:介绍统一分子生成模型在KRAS G12D与PCSK9上的跨模态设计结果,可作为多模态药物设计的参照。

4月13日周一
  1. HouMed73

    LaMGen:基于大语言模型的多靶点3D分子生成框架发表于Nature Communications

    浙江大学康玉、侯廷军团队联合澳门理工大学刘焕香团队在Nature Communications发表LaMGen,一个仅输入靶蛋白氨基酸序列即可生成3D活性分子的多靶点药物设计框架。

    推荐理由:研究用LLM从蛋白序列直接生成多靶点3D分子,并在分布外靶点对上与DualDiff比较。

4月9日周四
  1. 1910 Genetics63

    1910 Genetics在J. Med. Chem.发表PEGASUS:用大规模并行生物实验数据构建AI模型解析细胞穿透环肽极性

    1910 Genetics在J. Med. Chem.发表题为PEGASUS的论文,介绍用基于大规模并行生物实验构建的AI模型解析细胞穿透环肽的极性。论文链接为https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.5c01836,具体模型性能与实验数据未在帖文中披露。

    推荐理由:该论文介绍基于大规模并行生物实验数据构建的AI模型,用于理解细胞穿透环肽的极性规律。