实测:直接要求 Opus 5 解释 ProteinMPNN 机制,可精确编辑约 1% 权重获得类似 SolubleMPNN 的行为
直接要求 Opus 5 对 ProteinMPNN 做机制解释后,其精确编辑约 1% 权重,使模型表现出类似 SolubleMPNN 的行为。作者同时指出图表内容有些像模型生成的胡言乱语,且 030 模型在未编辑时已表现得像 SolubleMPNN。
直接要求 Opus 5 对 ProteinMPNN 做机制解释后,其精确编辑约 1% 权重,使模型表现出类似 SolubleMPNN 的行为。作者同时指出图表内容有些像模型生成的胡言乱语,且 030 模型在未编辑时已表现得像 SolubleMPNN。
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🧬 昨天关于 RFD4-Proteina 的直播已添加时间戳!✨ 围绕 IPD × NVIDIA 共同开发的蛋白质设计模型,从原理到研究成果进行了解说! 可以从感兴趣的部分开始观看,错过直播的朋友、想再复习一遍的朋友都欢迎观看!🩵🩷
上周的 Paper Talk 里简单介绍了 RFD4-Proteina。还没看的朋友可以去看存档哦 多亏 RFD4-Proteina 的 MLX/Metal 实现也出来了,现在在 Mac 上也能轻松试用,真让人高兴
📅 11/1 10AM (JST) 将进行论文讲解直播! 本次主题是 RFD4-Proteina 蛋白质设计进化到了什么程度? 将讲解利用 Latent Reasoning 的新型生物分子设计模型 周日上午,和ゆい一起学习最新研究吧! 初次观看的朋友也欢迎!✨ 直播链接在回复🔽
Anthropic 与 Adaptyv 蛋白设计竞赛的最后一个挑战要求设计能结合突变型 KRAS 片段、而不结合对应的野生型(非突变)KRAS 片段的结合剂,以便免疫系统识别并攻击癌细胞。该挑战以 KRAS G12D 为靶点,提交截止日期为 11 月 8 日,之后主办方将挑选优秀设计并在实验室测试。Amir Shanehsazzadeh 转发该公告并点出最后一题为 KRAS G12D。
要让生物学可编程,我们需要看见我们所制造的分子,并从中学习。 今天,@annejecrois 将分享我们团队如何构建高通量冷冻电镜平台,以生成用于训练我们抗体设计 AI 模型的结构数据。 她的演讲《CryoEM:从技艺到设计引擎》将于美国东部时间上午 10:55 在马萨诸塞州剑桥市赛诺菲举办的“Celebrating Womenin Structural Biology & Drug Discovery”活动上开始。 查看议程 → https://www.nesba.net/
我对@TwistBioscience团队感激不尽!Claude是分子设计的重大加速器和赋能者,但直到在实验室看到结果,这一切才有意义。这些蝎毒素非常难处理,Twist团队完成了一项漂亮的Cn2竞争实验,让我们对结果有了更大的信心🦂
Anthropic与Adaptyv蛋白质设计竞赛第4期在proteinbase开放,任务是设计靶向TfR1特定区域的pH敏感结合剂,帮助药物穿越血脑屏障进入大脑。TfR1在血脑屏障高表达,可将载铁转铁蛋白带入细胞;药物与TfR1结合剂融合后被细胞吸收,pH敏感结合剂在内涵体内释放,再从面向大脑一侧离开细胞递送治疗药物。
同一新闻,精选展示《Anthropic × Adaptyv 蛋白质设计竞赛第4期以TfR1为靶点,要求设计pH敏感结合剂》
Anthropic × Adaptyv 蛋白质设计竞赛第三题开放,要求参赛者设计能激活 GLP1R 的蛋白质。GLP1R 是司美格鲁肽(Ozempic、Wegovy)和替尔泊肽在 2 型糖尿病与肥胖中作用的受体。
Anthropic 与 Adaptyv 蛋白设计竞赛公布第二道挑战,目标是为 TNF-α 设计更优结合剂,并要求其在细胞内体 pH 6.0 条件下选择性释放以改善药物半衰期。该设计还需同时结合人源和小鼠 TNF-α,以便在临床前模型中测试同一设计;Amir Shanehsazzadeh 转发称该靶点本身对结合剂设计就很难,pH 要求进一步加大难度。
Adaptyv Bio 宣布 Anthropic x Adaptyv 蛋白设计竞赛第二期,目标是设计优于现有药物的 TNF-α 结合剂,并能在细胞内体 pH 6.0 条件下选择性释放以改善药物半衰期。设计要求还包括同时结合人源和小鼠 TNF-α,以便在临床前模型中测试同一设计。
推荐理由:比赛把 TNF-α 结合剂设计放到 pH 6.0 选择性释放和跨人鼠结合的双重约束下,可观察设计如何兼顾亲和力与可开发性。
很高兴我们的Evo-Φ36冷冻电镜结构在PDB 55周年的“月度分子”文章中获重点介绍! 获得这个结构是@_David_Li @samuelhking @driscoll_cl @maxewilkinson的出色工作。 https://pdb101.rcsb.org/motm/322