浙江大学侯廷军团队发布PROTAC-DB 4.0，整合分子胶与XTAC并引入LLM问答
浙江大学侯廷军团队联合中国药科大学等在Nucleic Acids Research发表PROTAC-DB 4.0，将数据库从PROTAC扩展至分子胶和XTAC。
推荐理由：该论文把PROTAC、分子胶与XTAC数据整合进统一知识库，并给出LLM加RAG的检索架构，可作为靶向降解数据资源与AI建模的参照。
#靶点发现
DrugAI精选AI 评分6868 医药魔方精选AI 评分5858 Differentia Bio以IgG4-RD前瞻性预测获独立临床验证，推进虚拟人体模拟
Differentia Bio称其针对IgG4相关性疾病（IgG4-RD）的机制预测先后获得独立人体临床研究支持：2025年4月靶向CD19+的inebilizumab获FDA批准用于该适应症，2026年1月第三方公布的dupilumab早期研究中5名患者有4名出现临床改善及血清IgG4水平下降。
推荐理由：文章梳理了Differentia Bio先预测后获独立临床证据支持的案例，为评估AI疾病模型提供参照。
Edison Scientific精选AI 评分5858 Edison Scientific 推出 Kosmos Target Assessment 靶点评估工具
Edison Scientific 发布 Kosmos Target Assessment（TA），这是 Kosmos 的专用版本，用于筛选最具成药潜力的治疗候选靶点，与 Incyte 合作开发。
推荐理由：Kosmos TA 与 Incyte 合作开发，把安全性、可成药性与竞争情报等维度纳入靶点评估，并给出与委员会实验请求的一致率。
Open Targets · Blog精选AI 评分6767 Open Targets 发布 Mira 临床数据管线，整合 23 个来源增强平台临床试验证据
Open Targets 发布临床数据挖掘管线 Mira（Multi-source Indication & Report Analytics），整合 ClinicalTrials.gov、DailyMed、PMDA、EMA 等 23 个来源，在 26.09 版本产出 289,954 条临床报告、覆盖 13 个研发阶段。
推荐理由：介绍 Open Targets 新临床数据管线如何整合 23 个来源并重估靶点临床先例，可了解其数据口径与阶段映射变化。
DrugAI精选AI 评分6666 伯克利团队在Science提出刺激性蛋白降解SPD策略，小分子BD2激活CUL2-FEM1B改善线粒体功能
加州大学伯克利分校Michael Rapé团队在《Science》发表研究，提出刺激性蛋白降解（SPD）策略，用小分子解除BEX蛋白对E3连接酶CUL2-FEM1B的抑制，促进其天然底物降解。
推荐理由：研究提出激活E3连接酶天然底物清除的SPD策略，为多蛋白异常疾病提供不同于PROTAC的作用模式参照。
王初课题组精选AI 评分6363 Nat. Chem. Biol. | 基于蛋白质组发现并缓解雄激素受体降解剂的肝毒性
阿斯利康团队在Nature Chemical Biology发表研究，用DIA蛋白质组流程筛查204个雄激素受体异双功能降解剂（AR-HBD），将肝毒性定位至线粒体复合体Ⅰ，并据此改造出低毒性化合物3号。
推荐理由：研究用DIA蛋白质组与机器学习把AR降解剂肝毒性定位到线粒体复合体Ⅰ，并据此改造出低毒性候选化合物。
LeapFun精选AI 评分5858 Bruce Booth 警告 AI 药物供给过剩，Biotech 将迎来消化不良
Atlas Venture 合伙人 Bruce Booth 在 LifeSciVC 发文《The Fruits of AI Drug Abundance: Indigestion In The Near Term》，判断 AI 长期能帮制药做出更好的药，但未来 3–5 年在分子设计层面更可能先制造一轮药物丰裕，把行业整体研发生产率推得更糟。
推荐理由：文章转述投资人 Bruce Booth 对 AI 药物丰裕的判断，并梳理评论区关于差异化与估值的分歧。
智药邦精选AI 评分7878 上海药物所郑明月等发布MolGenBench：系统评测17种AI药物生成模型
同济大学、中国科学院上海药物研究所、上海科技大学与临港实验室团队在《Nature Communications》发表论文，构建结构基础药物发现评测基准MolGenBench，在120个蛋白质靶点和600个化合物系列上系统评估17种分子生成方法，覆盖从头设计与苗头到先导优化两个阶段。
推荐理由：该研究用120个靶点和600个化合物系列横向比较17种分子生成方法，为判断生成模型能否产出真实活性分子提供参照。
动脉网精选AI 评分6060 砺博生物完成近亿元A轮融资，推进靶向RNA小分子管线临床研发
砺博生物宣布近日完成近亿元人民币A轮融资，由正心谷资本、创新工场美元基金和某产业医疗基金联合领投，老股东元生创投追加，资金用于既有管线临床研发及全球商业化布局。
推荐理由：报道披露砺博生物A轮融资与RP-0172临床进展，可了解RNA三级结构AI4S平台如何支撑靶向RNA小分子发现。
药化猩球精选AI 评分5858 能结合却无药效的分子还能做什么：从沉默结合到PROTAC与RiboTAC的药化设计
作者费米子父梳理了沉默结合配体在诱导邻近技术中的再利用路径，涵盖SAR by catalog、RiboTAC、RNATAC、RIPTAC与PhosTAC。文中引用Disney团队2023年Nature研究，将结合RNA但无功能效应的小分子接上RNase L招募模块后成为降解剂；Tong等2024年全转录组研究中481个结合RNA靶标仅5个达到RNase L依赖切割标准。
推荐理由：文章把沉默结合配体与多种诱导邻近技术串成一套设计检查框架，便于理解配体再利用的取舍。
王初课题组精选AI 评分5858 ACS Cent. Sci.：茚三酮作为靶向精氨酸残基的化学探针
Scripps研究所与UCSF团队将茚三酮开发为精氨酸选择性共价弹头，并在Mino细胞蛋白质组中鉴定出6888个反应性精氨酸位点，其中410个为高反应性位点。DFT计算显示水溶液中茚三酮亲电活性高于PGO，体外实验显示其可与Fmoc-Arg反应而不与Fmoc-Lys反应。
推荐理由：该研究把茚三酮改造成精氨酸选择性共价弹头，为拓展共价药物可靶残基范围提供了可迁移的探针设计思路。
智药邦精选AI 评分5858 Flagship Pioneering 组建 Etcelera，整合三家平台推动药物发现从概率走向预测
Flagship Pioneering 于2026年10月29日宣布组建 Etcelera，由 Cellarity、Etiome 与 Empress Therapeutics 的平台业务合并而成，目标是在临床试验前明确疾病驱动因素并预测药物在患者体内的作用。
推荐理由：Flagship 将三家平台公司合并为 Etcelera，其整合数据与模型规模为观察因果智能路线提供了具体样本。
机器之心 · AI4Science精选AI 评分7474 斯坦福团队在Science发布Virtual Biotech多智能体框架，从临床试验中挖掘药物研发线索
斯坦福大学团队于2026年9月17日在Science发表研究，推出多智能体AI平台Virtual Biotech，由虚拟首席科学官统筹8个专业科学家智能体，模拟生物技术公司研发架构。
推荐理由：斯坦福团队用多智能体框架整合临床试验与单细胞数据，为靶点特征与临床成功率之间的关联提供了可复用的分析路径。
科普知识综述精选AI 评分5858 约翰斯·霍普金斯大学获ARPA-H最高5210万美元资助，构建AI模型解码蛋白质错误折叠
约翰斯·霍普金斯大学牵头获ARPA-H最高5210万美元、为期4年的资助，将构建AI模型解码内在无序蛋白在帕金森病、尤文肉瘤等疾病中的错误折叠与动态构象，项目名为DETR，由Xiaobo Mao领导，21名研究人员来自美欧12家机构。
推荐理由：梳理ARPA-H资助的蛋白质动态构象项目，区分结构预测、机制确认与临床转化三层证据。
王初课题组精选AI 评分5858 Nat. Chem. Biol. | Tryptoline立体探针结构拓展发现GRPEL1–HSPA9复合物抑制剂
Scripps研究所的Bruno Melillo与Benjamin F. Cravatt团队在Nat. Chem. Biol.发表研究，通过改造Tryptoline丙烯酰胺探针的C6/C7远端结构，在Ramos细胞中定量超过24,000个半胱氨酸位点，筛出95个可被立体选择性标记的位点。
推荐理由：研究用立体探针扩展半胱氨酸配体图谱，并借GRPEL1案例展示结构预测在非正构位点的识别局限。
BioArt精选AI 评分7272 贾伟团队在Cell Metabolism发表AI驱动胆汁酸发现框架MetLLM与MetSpace
贾伟团队在Cell Metabolism发表研究，用transformer架构的分子语言模型MetLLM对胆汁酸样结构打分，从超过52万个含四环骨架的结构中筛出3900个优先候选，构建候选图谱MetSpace。
推荐理由：研究把分子语言模型与质谱鉴定、细胞实验串成代谢物发现流程，展示了从候选预测到结构确认的完整路径。
BioArt精选AI 评分7272 Nature：Shokat团队提出双位点激酶抑制剂设计原则并开发PonatiLink-2
加州大学旧金山分校Kevan M. Shokat与Kevin Lou团队在Nature发表研究，以ABL1和EGFR为模型系统梳理双位点激酶抑制剂的设计原则，并开发出双位点ABL1抑制剂PonatiLink-2。
推荐理由：研究以ABL1与EGFR为模型系统梳理双位点激酶抑制剂的设计参数，为兼顾效力与选择性提供可迁移思路。
医药魔方精选AI 评分7171 阿斯利康与insitro达成MASH与心肌病独家合作，首付4000万美元
insitro与阿斯利康达成全球独家研究合作，针对MASH与心肌病开展新靶点与创新疗法发现，insitro获4000万美元首付款，并有资格获得最高约14.6亿美元里程碑付款及个位数比例销售提成。
推荐理由：梳理阿斯利康与insitro的MASH与心肌病合作条款，并拆解insitro虚拟人类平台从靶点发现到分子设计的链路。
GEN (基因工程与生物技术新闻)精选AI 评分5858 多组学研究揭示MSS结直肠癌的可靶向弱点
RCSI与英国癌症研究院领衔的国际团队整合约2000例结直肠癌肿瘤的多组学、单细胞与临床数据，开发AI工具iPhenMap构建肿瘤生物学图谱，识别出MSS结直肠癌此前未被发现的弱点。在实验室模型中，靶向药trametinib与其他药物联用可显著抑制肿瘤生长并延长生存，研究结果发表于Cancer Cell，仍属临床前阶段。团队称该结果可为现有药物重定位和新药开发提供路线图，并可能推广至其他瘤种。
推荐理由：研究整合约2000例结直肠癌肿瘤的多组学与单细胞数据，为MSS CRC的联合用药与老药新用提供临床前线索。
Pathos AI 官网资讯精选AI 评分5858 Pathos AI 完成 2.37 亿美元 E 轮融资，投后估值约 30 亿美元
Pathos AI 宣布完成 2.37 亿美元 E 轮融资，投后估值约 30 亿美元，由百时美施贵宝领投，现有投资方参投。资金将用于扩展其 Foundry 平台，并推进 TROP2/HER3 双特异性抗体偶联药物 JSKN-016 进入注册研究，同时推进 pocenbrodib、与阿斯利康合作的 ER PROTAC AZD4241 及 MET 激酶抑制剂 DO-2 的临床开发。
推荐理由：融资将用于推进 AI 平台筛选出的肿瘤资产进入注册研究，可观察 AI 在临床决策中的实际角色。