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Boltz 最新动态

Boltz 的生物分子基础模型、开源结构预测与生成设计平台。

9 条精选近 30 天 5 条共收录 16 条

更新

Boltz的精选

11月2日周一第 1–9 条
  1. bioRxiv · Bioinformatics70

    可微自旋中心扩散模型实现DEER引导的加权蛋白质构象集合生成

    作者提出可微的自旋中心(SC)扩散模型,可调节自旋标记的旋转异构体宽度,并与冻结的Boltz-2结构生成器耦合,使完整实验P(r)在推理阶段引导构象集合生成。在已知组成的合成P(r)上,该流程恢复了集合布居数,包括双峰分布的两个组分;在PfMATE、LmrP、MhsT和P-糖蛋白上,依据不同生化条件下测得的实验P(r)建模集合,并据此推导条件依赖的自由能差。

    推荐理由:该预印本把可微自旋标记模型接入结构生成,使DEER距离分布可直接约束构象集合生成。

10月31日周六
  1. Gabriele Corso73

    Ebolathon 团队用 Boltz API 设计分子,140 个中筛出 11 个埃博拉假病毒选择性命中

    Gabriele Corso 表示,Ebolathon 黑客松团队使用 Boltz API 设计新分子,共测试 140 个分子,在埃博拉假病毒实验中筛出 11 个选择性命中。他称这体现了黑客松想法转化为实验结果,并附 muni.bio 的研究链接。

    推荐理由:记录一场黑客松用 Boltz API 设计分子并在埃博拉假病毒实验中筛出选择性命中,呈现从计算到湿实验的转化路径。

10月21日周三
  1. ChemRxiv Preprints65

    研究利用 Boltz-2 发现纳摩尔级 CDK2 抑制剂

    研究将 Boltz-2 的亲和力模块与自建的四氢喹啉类筛选空间结合,用于 CDK2 的虚拟筛选和命中优化,得到纳摩尔级抑制剂。该筛选空间通过单步多组分反应获得,作者称此前基于此类模型的虚拟筛选多局限于商业化合物目录。材料仅为预印本摘要,未披露具体化合物数量、活性数值与实验验证细节。

    推荐理由:预印本报告 Boltz-2 亲和力模块在自建四氢喹啉筛选空间中完成虚拟筛选与命中优化,为共折叠模型的前瞻性应用提供案例。

10月15日周四
10月14日周三
  1. 智药局62

    Boltz小分子模型BoltzMol-1接入药明康德GalaXi化学空间

    Boltz于10月13日宣布,其小分子模型BoltzMol-1可直接搜索药明康德的GalaXi虚拟化合物库,该库规模约260亿个可合成分子,已在Boltz Lab平台和Boltz API上线供全球用户调用。

    推荐理由:BoltzMol-1接入药明康德GalaXi化学空间,反映AI小分子模型对可合成化合物库的依赖。

10月2日周五
  1. DrugIntel74

    预印本追踪 Boltz-2 的 Pose→Affinity 信息流:亲和力头实际读取第二套结构

    Xeureka 的 Kazuya Ujihara 在 ChemRxiv 预印本中通过源码追踪和分层干预,分析开源 Boltz 2.2.1 的蛋白–配体亲和力推理通路,发现结构预测先决定 affinity crop,affinity pass 再对该 crop 重新扩散生成第二套结构,亲和力头读取的是这套结构而非用户看到的 written structure。

    推荐理由:源码追踪拆出 Boltz-2 亲和力预测的三条信息通路,为判断结构模型是否真正利用结合几何提供可迁移的审计方法。

9月25日周五
  1. AI蛋白质72

    药企联盟用2万余条私有蛋白结构数据微调OpenFold3,提升药物结合预测

    由艾伯维、BMS、强生等药企组成的AISB Network利用OpenFold3,在五家公司提供的20,167个蛋白质-配体复合结构上微调,私有数据受保护且不公开。

    推荐理由:药企联盟用两万余条私有结构微调开源模型,为数据共享能否提升结合预测提供了对照参照。

9月18日周五
  1. ACS JCIM (化学信息与建模)73

    研究用DNA编码库数据评估机器学习与物理方法的泛化能力

    【全文总结】该研究基于BELKA的约1.33亿个DNA编码库分子(针对sEH、BRD4、HSA三个靶点)评估蛋白-配体结合预测方法的泛化性,配体ML模型在分布内集表现最好,在分布外集接近随机。

    推荐理由:研究用DEL超高通量筛选数据系统比较配体ML、对接与共折叠方法在分布外化合物上的命中判别表现。

7月22日周三
  1. A-Alpha Bio 官网资讯72

    A-Alpha Bio 发起 Atlas Consortium 数据联盟,GSK、Boltz、Cradle、Dyno Therapeutics 为首批成员

    A-Alpha Bio 宣布成立 Atlas Consortium,首批五家创始成员包括 GSK、Boltz、Cradle 和 Dyno Therapeutics,以订阅制按季度设计并共享标准化抗体抗原实验数据。

    推荐理由:该联盟以订阅制汇集标准化抗体抗原实验数据,为AI抗体设计提供可比的亲和力与结构训练资源。