bioRxiv · Bioinformatics· Kao, T.-Y., Meiler, J., Mchaourab, H. S. ·· 8 天前精选AI 评分70
可微自旋中心扩散模型实现DEER引导的加权蛋白质构象集合生成
Differentiable Spin-Center Diffusion Model Enables DEER-Guided Generative Pipeline of Weighted Protein Ensembles
AI 导读
作者提出可微的自旋中心（SC）扩散模型，可调节自旋标记的旋转异构体宽度，并与冻结的Boltz-2结构生成器耦合，使完整实验P(r)在推理阶段引导构象集合生成。在已知组成的合成P(r)上，该流程恢复了集合布居数，包括双峰分布的两个组分；在PfMATE、LmrP、MhsT和P-糖蛋白上，依据不同生化条件下测得的实验P(r)建模集合，并据此推导条件依赖的自由能差。
推荐理由
该预印本把可微自旋标记模型接入结构生成，使DEER距离分布可直接约束构象集合生成。
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