Molence 发布结合位点引导模型 Mol-1-constraint
先了解这件事
Molence Bio 于 11 月 10 日在 GitHub 发布 Mol-1-constraint,在 Mol-1 结构预测模型基础上加入结合位点约束引导能力,并开放专用权重。模型在序列和分子组成之外可输入 SITE、CONTACT、EXCLUSION 三类线索,在预测前引导复合物结构;它预测给定分子组成的三维结构,不生成新抗体序列,也不直接预测结合亲和力。约束是引导信号而非硬规则,输出仍可能违反约束,官方流程不会自动过滤;新功能位于官方仓库 constraint 分支,需匹配专用权重。 Molence 称,在给定参考表位或口袋输入时,该模型于 FoldBench 靶点上五项受测模型中表现最好:抗体抗原界面 DockQ>0.80 成功率 45.4%,比 Boltz-2 的 25.6% 高 19.8 个百分点;蛋白配体标准成功率 75.1%、严格成功率 55.4%,Boltz-2 分别为 63.8% 和 36.6%。评测覆盖所有模型共用的 160 个 FoldBench 抗体抗原界面和 511 个蛋白配体界面。 与自家 Mol-1 相比,FoldBench-AB 上 DockQ>0.23 成功率从 75.0% 升至 88.3%;Runs N' Poses 0–20 相似度区间蛋白配体成功率从 36.1% 升至 63.9%;MolBench-Peptide-26 上 DockQ>0.80 蛋白肽成功率从 54.1% 升至 60.2%。上述均为 Molence 自述的基准结果。
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事件进展
2 个进展
- 11月11日 16:08 · 2 篇报道Molence发布Mol-1-constraint约束结构预测BioAIDesign:Molence Bio 发布 Mol-1-constraint:让结合位点线索参与结构预测
- 11月11日 14:31 · 2 篇报道Mol-1-constraint在FoldBench结合位点评测中领先Molence:Molence 发布 Mol-1-constraint 结合位点引导模型,FoldBench 抗体抗原 DockQ 达 45.4%
报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
- 下一分子AI制药日报|NovaAtom-Lite、Mol-1-constraint与AlphaGenome 2等模型密集发布
Geodesic Intelligence发布全原子结构预测模型NovaAtom-Lite并通过API与NovaDDE平台提供使用,Molence Bio推出可输入SITE、CONTACT、EXCLUSION三类结合线索的Mol-1-constraint。
- BioAICraft精选Molence Bio 发布 Mol-1-constraint,为 Mol-1 结构预测加入结合位点与接触约束
Molence Bio 于 11 月 10 日在 GitHub 发布 Mol-1-constraint,为原有 Mol-1 生物分子结构预测模型加入约束引导能力并开放专用权重。
- BioAIDesign精选Molence Bio 发布 Mol-1-constraint:让结合位点线索参与结构预测
Molence Bio 推出基于 Mol-1 微调的 Mol-1-constraint,可在序列与分子组成之外输入 SITE、CONTACT、EXCLUSION 三类结合线索,在预测前引导复合物结构。
- Molence精选Molence 发布 Mol-1-constraint 结合位点引导模型,FoldBench 抗体抗原 DockQ 达 45.4%
Molence 发布结合位点引导模型 Mol-1-constraint,在给定参考表位或口袋输入时,于 FoldBench 靶点上五项受测模型中表现最好。抗体抗原界面在 DockQ >0.80 下为 45.4%,比 Boltz-2 的 25.6% 高 19.8 个百分点;蛋白配体标准成功率 75.1%、严格成功率 55.4%,Boltz-2 分别为 63.8% 和 36.6%。
- Molence精选Molence 发布 Mol-1-constraint 共折叠模型,三项基准成功率均提升
Molence 发布 Mol-1-constraint 共折叠模型,并给出其与 Mol-1 及主流开源共折叠模型的基准对比。在 FoldBench-AB 抗体抗原任务上,DockQ>0.23 的成功率从 Mol-1 的 75.0% 升至 88.3%;在 Runs N' Poses 的 0–20 相似度区间,蛋白配体成功率从 36.1% 升至 63.9%,比 Mol-1 高 27.8 个百分点;在 MolBench-Peptide-26 上,DockQ>0.80 的蛋白肽成功率从 54.1% 升至 60.2%。
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