bioRxiv · Genomics· Park, J., Sim, H., Hwang, B. ·· 4 天前精选AI 评分60
基因相似度框架量化先验知识与扰动响应一致性，用于评估靶点级可预测性
Gene-level structure of prior knowledge and perturbation responses informs target-level predictability in prior-informed models
AI 导读
研究提出基因相似度框架，量化八类生物先验知识之间以及先验知识与六套 Perturb-seq 数据中共功能、共调控关系的一致性。在全基因组和必需基因筛选中，先验一致性分别解释共功能一致性方差的 30-47% 和共调控一致性的 35-43%；与 Perturb-seq 响应的一致性在必需基因中更高，在转录因子和信号基因中更低，并随基因表达特征和细胞环境变化。
推荐理由
研究用基因相似度框架比较八类先验知识与六套 Perturb-seq 响应的一致性，为扰动预测的可预测性提供事前参照。
来源：bioRxiv · Genomics · biorxiv.org