bioRxiv · Bioinformatics· Verma, S., Wang, M., Kadadi, S. D., Lanman, N. A., Mohammadi, S., Grama, A. ·· 5 天前精选AI 评分62
SPEAR：面向流式单细胞扰动建模的谱自适应重定位框架
Spectral Adaptive Repositioning for Flow-Based Single-Cell Perturbation Modeling
AI 导读
作者提出生成式框架 SPEAR，用图拉普拉斯导出的谱位置编码和逐层扰动条件自适应重定位来建模单细胞扰动响应。在遗传、药物和细胞因子扰动基准上，SPEAR 报告了差异基因表达恢复、分布结构和扰动特异性可识别性的表现，并捕捉到与已知转录因子-靶标互作相近的潜在位置关系。该工作为预印本摘要，代码见 https://github.com/shouryaverma/SPEAR。
推荐理由
该预印本用谱位置编码与自适应重定位替代静态基因位置，为扰动响应建模提供可迁移的架构思路。
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