SPEAR：谱位置编码预测单细胞扰动响应

Verma 等作者在 bioRxiv 发布预印本，提出生成式框架 SPEAR，用于预测单细胞对扰动的响应。该框架用图拉普拉斯导出的连续坐标，把每个基因定位在共表达网络的几何结构中；再在每一层根据扰动条件下的隐藏状态重新确定基因位置，使基因间注意力无需显式监督即可重组。 作者称，在遗传、药物和细胞因子扰动基准上，SPEAR 在差异基因表达恢复、分布结构和扰动特异性可识别性方面表现良好，并捕捉到与已知转录因子—靶标互作相近的潜在位置关系。上述为预印本摘要中的自述结果，代码已公开在 GitHub。

AI 根据报道生成 · 4 天前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。