研究用口袋相似性指导蛋白靶点选择以生成系统性蛋白-配体数据集

研究提出以口袋相似性而非序列或折叠相似性作为选择代表性靶点的标准，用PocketVec在15,559个蛋白中识别出51,535个预测可成药口袋。这些口袋经两级层次聚类归为1,865个化学相似结合位点簇，剔除533个含已知配体的簇后，从剩余1,332个无配体簇中选取100个成员最多的簇，每簇选两个高质量代表口袋。