Bioinformatics (Oxford)· Zhou Y, Li J, Liu S, Wang Z, Liu R, Zhu Z, Zhu T, Zhang J.·· 11 天前精选AI 评分63
PRIDA:基于生物语言模型与条件域对抗学习的跨域蛋白-RNA互作预测框架
PRIDA: Cross-domain protein-RNA interaction prediction based on biological language models and conditional domain-adversarial learning.
AI 导读
【摘要级】研究提出PRIDA,一个结合双线性注意力与条件域对抗学习的蛋白-RNA互作预测框架,借助预训练蛋白和RNA语言模型,在蛋白层面分布偏移和标注数据有限时提升互作预测表现。作者称其在跨域蛋白-RNA互作预测上达到当前最优性能,并将PRIDA与蒙特卡洛树搜索结合用于虚拟筛选流程,为特定靶点蛋白生成RNA适配体候选。数据与源代码已在GitHub和Zenodo公开。
推荐理由
该框架用条件域对抗学习应对蛋白层面的分布偏移,为跨域蛋白-RNA互作预测提供了一种可复用的思路。
来源:Bioinformatics (Oxford) · doi.org