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PRIDA框架用于跨域蛋白-RNA相互作用预测

1 篇报道1 个报道来源11 天前更新

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AI 综述

Zhou Y等作者提出并发布PRIDA蛋白-RNA互作预测框架,结合双线性注意力与条件域对抗学习,并借助预训练蛋白和RNA语言模型。作者称,在蛋白层面分布偏移和标注数据有限时,PRIDA能提升互作预测表现,并在跨域蛋白-RNA互作预测上达到当前最优性能。 作者还将PRIDA与蒙特卡洛树搜索结合,用于虚拟筛选流程,为特定靶点蛋白生成RNA适配体候选;作者称该框架可为RNA适配体虚拟筛选提供有效指导。数据与源代码已在GitHub和Zenodo公开。

AI 根据报道生成 · 8 天前更新

报道时间线

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10月29日
  1. Bioinformatics (Oxford)精选
    PRIDA:基于生物语言模型与条件域对抗学习的跨域蛋白-RNA互作预测框架

    【摘要级】研究提出PRIDA,一个结合双线性注意力与条件域对抗学习的蛋白-RNA互作预测框架,借助预训练蛋白和RNA语言模型,在蛋白层面分布偏移和标注数据有限时提升互作预测表现。作者称其在跨域蛋白-RNA互作预测上达到当前最优性能,并将PRIDA与蒙特卡洛树搜索结合用于虚拟筛选流程,为特定靶点蛋白生成RNA适配体候选。数据与源代码已在GitHub和Zenodo公开。

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