bioRxiv · Bioinformatics· Mondal, K., Padi, S., Kaur, N., Makambi, W., Hoogerheide, D. P., Heinrich, F., Mihailescu, M., Klauda, J. B., Cardone, A. ·· 5 天前精选AI 评分70
XAMPGen：可解释生成流程用于新型抗菌肽发现
XAMPGen: An Interpretable SI Pipeline For Novel Antimicrobial Peptide Discovery
AI 导读
研究提出XAMPGen流程，在已知抗菌肽上微调仅解码器蛋白语言模型ProGen生成新肽序列，并用探针分类器、回归器和自注意力分析定位编码功能关键信息的层。候选序列按预测最低抑菌浓度（MIC）和膜结构活性筛选后进入实验，作者称所有生成并测试的肽在MIC生物测定中均显示抗菌活性，荧光与圆二色谱提供了结构信息；该结果为bioRxiv预印本摘要报告。
推荐理由
预印本把生成模型与可解释性分析结合，并给出生成肽的MIC实测结果，可作为抗菌肽发现的参考路径。
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