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生成式模型设计抗菌肽并经实验验证活性

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AI 综述

Mondal等作者在bioRxiv发布预印本,提出XAMPGen流程:在已知抗菌肽上微调仅解码器蛋白语言模型ProGen,生成新肽序列,再用探针分类器、回归器和自注意力分析定位编码功能关键信息的层。候选序列按预测最低抑菌浓度(MIC)和膜结构活性筛选后进入实验。 作者称,所有生成并测试的肽在MIC生物测定中均显示抗菌活性,荧光与圆二色谱测量提供了结构信息。上述结果来自预印本摘要报告,尚未经同行评议。

AI 根据报道生成 · 4 天前更新

报道时间线

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11月4日
  1. bioRxiv · Bioinformatics精选
    XAMPGen:可解释生成流程用于新型抗菌肽发现

    研究提出XAMPGen流程,在已知抗菌肽上微调仅解码器蛋白语言模型ProGen生成新肽序列,并用探针分类器、回归器和自注意力分析定位编码功能关键信息的层。候选序列按预测最低抑菌浓度(MIC)和膜结构活性筛选后进入实验,作者称所有生成并测试的肽在MIC生物测定中均显示抗菌活性,荧光与圆二色谱提供了结构信息;该结果为bioRxiv预印本摘要报告。

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