arXiv · q-bio.BM (生物大分子)· Anton E. Dorn, Emile de Bruyn, Fabrice von der Lehr, Philipp Knechtges, Stefan Kesselheim, Alexander Schug·· 13 天前精选AI 评分62
mdRNAcat发布48个RNA体系的REST2分子动力学构象数据集
mdRNAcat: A Molecular Dynamics RNA Catalog of REST2 Conformational Ensembles
AI 导读
研究团队发布mdRNAcat，一个包含48个RNA体系全原子分子动力学模拟的精选数据集，体系选择以提升序列多样性为目标。每个体系采用溶质缩放副本交换（REST2）模拟，设32个哈密顿态，每态生产模拟长度200-300 ns，提供原子坐标、瞬时力以及未缩放参考哈密顿量下重新计算的力，并附结构注释与副本交换元数据。
推荐理由
该数据集用REST2增强采样覆盖48个RNA体系，为RNA数据驱动模型与粗粒化力场提供可复用的训练与评测资源。
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