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mdRNAcat发布48个RNA体系分子动力学数据集

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AI 综述

Anton E. Dorn等作者发布mdRNAcat,一个包含48个RNA体系全原子分子动力学模拟的精选数据集,体系选择以提升序列多样性为目标。 每个体系采用溶质缩放副本交换(REST2)模拟,设32个哈密顿态,每态生产模拟长度200–300 ns;提供原子坐标、瞬时力,以及在未缩放参考哈密顿量下重新计算的力,并附结构注释与副本交换元数据。 数据以标准化HDF5格式提供:参考态坐标和力为1 ps间隔,全部态为100 ps间隔;数据集及相关资源发布在Hugging Face的HelmholtzAI-FZJ组织下。

AI 根据报道生成 · 13 天前更新

报道时间线

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10月27日
  1. arXiv · q-bio.BM (生物大分子)精选
    mdRNAcat发布48个RNA体系的REST2分子动力学构象数据集

    研究团队发布mdRNAcat,一个包含48个RNA体系全原子分子动力学模拟的精选数据集,体系选择以提升序列多样性为目标。每个体系采用溶质缩放副本交换(REST2)模拟,设32个哈密顿态,每态生产模拟长度200-300 ns,提供原子坐标、瞬时力以及未缩放参考哈密顿量下重新计算的力,并附结构注释与副本交换元数据。

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