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DrugAI· DrugOne·· 4 天前精选AI 评分65

Nat. Commun.:可解释深度学习框架CPRISP预测环状RNA–RBP相互作用并探索神经退行性疾病候选分子

Nat. Commun. | 用于预测环状RNA–RBP相互作用及神经退行性疾病治疗发现的可解释深度学习框架

AI 导读

研究人员在Nature Communications提出可解释深度学习框架CPRISP,整合circRNA核苷酸组成、理化性质、二级结构、Circ2Vec预训练表征与ProteinBERT提取的RBP特征来预测结合位点,在37个RBP基准数据集上平均AUC达0.9874,高于CircSSNN的0.9230及其他方法约0.83至0.89的水平。

推荐理由

该框架把RBP蛋白特征纳入circRNA结合位点预测,并用消融与跨细胞系实验说明其贡献边界。

来源:DrugAI · mp.weixin.qq.com