bioRxiv · Biophysics· Veltri, E., Lovas, S. ·· 10 天前AI 评分44
层粘连蛋白衍生肽结合 Neuropilin-1 的 VEGF-A165 结合口袋
Laminin-Derived Peptides Bind Neuropilin-1 at the VEGF-A165 Binding Pocket
AI 导读
AlphaFold 3 复合物预测结合分子动力学与 FoldX 评分显示，层粘连蛋白衍生五肽 Ac-Tyr-Ile-Gly-Ser-Arg-NH2（peptide 1）对 NRP-1 经典 VEGF-A165 口袋的平均平衡占据率最高，为 60.3 ± 34.6%，高于其 retro（25.9 ± 32.7%）和 retro-inverso（21.4 ± 29.5%）类似物。
来源：bioRxiv · Biophysics · biorxiv.org