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8月19日周三
  1. Valence Labs 官网资讯58

    Valence Labs 谈虚拟细胞在药物研发管线中最该发力之处

    Valence Labs 发文认为,虚拟细胞最有价值的定位不是加速临床前流程,而是提升进入临床的候选质量,即做转化靶点验证。文章提出三个问题:靶点扰动是否在人类疾病生物学中产生预期效应、效应能否在患者生物变异中保持稳健、以及能否对疾病情境形成足够选择性;并建议在现有分子测量基准之外增加决策层评估,例如回溯识别后来因人类生物学不符预期而失败的假设。

    推荐理由:Valence Labs 提出虚拟细胞应聚焦转化靶点验证,而非仅加速临床前流程,并给出可操作的评估维度。

8月13日周四
8月12日周三
  1. Valence Labs 官网资讯58

    Valence Labs 回顾表型组学演进:从监督迁移学习到生成式基础模型

    Valence Labs 的 Inside Valence 文章梳理细胞表型组学从监督迁移学习走向自监督与生成式基础模型的路径,起点是 2019 年 Recursion 的 RxRx1 Kaggle 竞赛,该任务覆盖约 1,100 个 siRNA 条件、125,510 张图像,并在 50 多个实验批次中重复筛选。

    推荐理由:梳理细胞表型组学从监督迁移学习到生成式基础模型的演进,并说明RxRx3数据集在虚拟细胞研究中的支撑作用。

8月4日周二
  1. Valence Labs 官网资讯36

    Valence Labs 回顾 ICML 2026:AI4Bio 论文占比 2.5%,聚焦模型效率与扰动预测

    Valence Labs 回顾 ICML 2026,AI for biology 与健康方向论文占全部接收论文的 2.5%,在主题领域排名第 5。会议聚焦模型效率与转录组扰动预测,PerturbDiff、scBIG 等采用流匹配报告了当前最优性能,PerturbODE 则借助神经常微分方程推断基因调控网络。

7月1日周三
  1. Valence Labs 官网资讯72

    Valence Labs 发布全原子显式溶剂玻尔兹曼采样模型 AquaGen

    Valence Labs 发布 AquaGen,称其为首个全原子、显式溶剂、考虑周期性边界条件的生成模型,可从玻尔兹曼分布生成分子构型。该模型用 3D 图神经网络将噪声转为药物分子与水的全原子三维排布,再以力场评估能量、以灰盒方式计算绝对水合自由能,约需数百个样本即可获得相对 MD 参考约 1 kcal/mol 误差的结果,速度约为 MD 的 10 倍。

    推荐理由:介绍首个全原子显式溶剂玻尔兹曼采样模型,说明其相对分子动力学的速度与误差权衡。

6月19日周五
  1. Valence Labs 官网资讯58

    Valence Labs 提出 f-Trajectory Balance 损失族,用于分子生成与 LLM 的探索调优

    Valence Labs 的 Jason Hartford 介绍其 ICML 论文 f-Trajectory Balance,提出一族损失函数用于微调 GFlowNets、生成模型和 LLM,并支持离策略与在策略数据。

    推荐理由:作者从损失函数角度解释生成模型探索与利用的权衡,为分子生成和 LLM 微调提供可迁移的方法视角。

6月3日周三
  1. Valence Labs 官网资讯60

    显微图像深度学习究竟学到了什么:Valence Labs 作者谈基准与可解释性

    Valence Labs @ Recursion 的 Ihab 在文章中讨论显微图像深度学习模型究竟学到了什么,指出在部分细胞培养显微任务中,多个已训练模型的表现与未训练网络和像素统计等简单基线相近,说明基准分数中有一部分信号并不需要高层生物学表征。

    推荐理由:作者结合自身基准测试经验,讨论显微图像模型何时学到真实生物学信号、何时依赖技术捷径,并提出可解释基线的设计思路。