长江杯 GLP-1R 题目更新:靶点标签公布、序列范围扩至跨膜区、新颖性规则调整
长江杯蛋白设计大赛主办方在官网发布补充通知,对GLP-1R等靶点题目做三处改动:公布靶点携带的标签(一般为His-tag)以避免假阳性,GLP-1R序列范围从仅ECD(Ala21–Glu139)扩展至包含跨膜区以匹配"激动剂"要求,并更新新颖性规则——与已知minibinder或VHH比对区域覆盖总长度至少80%时,全长或CDR序列一致性须≤70%。
长江杯蛋白设计大赛主办方在官网发布补充通知,对GLP-1R等靶点题目做三处改动:公布靶点携带的标签(一般为His-tag)以避免假阳性,GLP-1R序列范围从仅ECD(Ala21–Glu139)扩展至包含跨膜区以匹配"激动剂"要求,并更新新颖性规则——与已知minibinder或VHH比对区域覆盖总长度至少80%时,全长或CDR序列一致性须≤70%。
“长江杯”2026全球AI蛋白质设计挑战赛于9月24日开赛,面向全球开放报名,承诺为不少于5000条从头设计的纳米抗体或迷你结合蛋白提供免费湿实验检测,并按亲和力排名颁发总额100万元人民币税前奖金。
又一届AI蛋白质设计大赛来了!
Adaptyv Bio与Anthropic合办的蛋白设计竞赛第五题开题,要求设计只结合突变KRAS片段、不结合野生型KRAS的结合剂,以助免疫系统识别癌细胞。官方公告仅称"突变KRAS片段",X用户提及KRAS G12D但未获官方确认,规则、评价指标与序列细节均未披露。提交截止日期为11月8日,之后主办方筛选并测试,结果公布时间未说明。
10 月 26 日,Anthropic 与瑞士蛋白工程公司 Adaptyv 联合举办的蛋白设计挑战赛放出第五题,要求设计只结合 KRAS G12D 突变肽(VVVGADGVGK)、不结合野生型肽(VVVGAGGVGK)的蛋白,两者仅第 6 位一个氨基酸不同,靶点为 HLA-A*11:01 呈递的 pMHC。
推荐理由:赛事把特异性拆成突变识别、肽依赖与亲和力三关,为从零设计结合剂的评测提供了具体参照。
Anthropic × Adaptyv 蛋白质设计竞赛第4期在 proteinbase 平台开放,靶点为 TfR1,要求设计能精确结合该受体特定位点的 pH 敏感结合剂,以帮助药物穿过血脑屏障进入脑内。作者 Amir Shanehsazzadeh 转述称,本期评测关注结合、小鼠交叉反应性与 pH 敏感性;TfR1 在血脑屏障高表达,pH 敏感结合剂可在内体中释放并从脑侧排出以递送治疗药物。
2026 NK2R AI蛋白设计挑战赛正在全球征集,北京科学智能研究院(AISI)受邀担任赛事支持单位之一。赛事信息与配图来自北京生物结构前沿研究中心官方微信公众号,具体规则以主办方在线报名页面为准。
清华大学北京生物结构前沿研究中心发起2026 NK2R AI蛋白设计挑战赛,要求设计100-150aa纳米抗体,界面iPTM>0.6并按△SASA排序,前300名进入湿实验验证,一、二、三等奖分别为5000、2000、1000美元。
镁伽科技于2026年10月18日上线Poreva Open全球AI蛋白质设计挑战赛官网,公布首批3道赛题与规则,10月19日起全球报名且不设地域限制。
推荐理由:镁伽以万级湿实验验证切入蛋白设计公共基准,可与Anthropic赛事及Ginkgo模式对照。
Adaptyv Bio 宣布,Google DeepMind 的 SynthID Bio 模型相关全部实验结果已在 Proteinbase 上线。据其引用的说明,SynthID Bio 是把水印写入 AI 设计蛋白质氨基酸序列的方法,Adaptyv Bio 在其实验室对这些蛋白质做了验证,实验数据现可在 Proteinbase 查看。
推荐理由:Google DeepMind 的 SynthID Bio 蛋白水印序列已由 Adaptyv Bio 完成实验验证,结果公开在 Proteinbase。
Adaptyv Bio蛋白质设计竞赛第一项挑战赛距截止还有两天,提交截止时间为10月6日(周二)。该挑战要求设计能在肿瘤酸性环境中结合EGFR、而在健康细胞中性pH下不结合,且须同时结合人源与鼠源EGFR变异体以便临床前测试。设计需通过ProteinBase平台提交。
临港实验室等十余家机构共同发起并主办的“长江杯”2026全球AI蛋白质设计挑战赛于9月24日启动,聚焦AI蛋白质从头设计与真实湿实验验证,选手针对不同靶点设计纳米抗体或迷你结合蛋白。大赛奖金总额100万元人民币,计划对不低于5000条设计序列免费开展涵盖表达、纯化、检测的湿实验检测。报名通道9月24日开启、10月31日截止,面向全球高校、科研院所、企业团队及个人开放。
“长江杯”2026全球AI蛋白质设计挑战赛于9月24日启动报名,聚焦AI蛋白质从头设计与真实湿实验验证,选手针对不同靶点设计纳米抗体或迷你结合蛋白。赛事奖金总额100万元人民币,计划对不低于5000条设计序列免费开展涵盖表达、纯化、检测的湿实验,报名10月31日截止。大赛由上海交通大学、上海人工智能实验室、临港实验室等共同发起主办,面向全球高校、科研院所、企业团队及个人开放。
推荐理由:赛事把纳米抗体与迷你结合蛋白设计同5000条序列的免费湿实验检测绑定,呈现AI蛋白设计的验证路径。
分子之心在第八届CMC-CHINA中国制药工业博览会期间获「2026未来药物物种FNS101」评选的「AI生物智造领航者」奖,并分享AI蛋白质设计在创新药与合成生物制造中的实践。其Fab-to-scFv工程化项目经AI首轮设计后亲和力提升约8倍至0.6nM,表达量提升至>0.5g/L,纯度提升至91.5%。在代糖生产相关工业酶项目中,酶熔解温度提高15°C,半衰期由2.3小时提升至近200小时。
我们的生物信息学与平台研发负责人Stephen Nayfach本周在@CSHL参加基因组工程:CRISPR前沿活动。如果你也在现场,欢迎找他打个招呼!👋 他将发表演讲,介绍如何利用我们的AI模型设计用于碱基编辑的CRISPR-Cas9变体("为突变特异性碱基编辑器设计编程PAM特异性"),并主持"CRISPR技术I"分会场。
Profluent团队下周将前往Summer RosettaCon!找到@jeffruffolo、@richardwshuai、@ShiakiMinami和Alex Hoffnagle,打个招呼👋 你可以在周四下午1:30听Richard谈论E1,我们的编码器模型(“E1:用于适应度和结构预测的检索增强蛋白质编码器”),Alex将在周一晚上7:30分享他在我们AI设计的碱基编辑器上的工作(“使用蛋白质语言模型设计可编程碱基编辑器”)。
百奥几何凭借原子级蛋白质基础大模型GeoFlow V3入选《2025 AIGC 行业创新榜 TOP100》。该模型首次将多步推理引入蛋白设计,在TSLP、IL-33等七个靶点的十项从头设计任务中平均命中率达18.7%,较上一代AI方法提升超百倍,最高亲和力36nM,先导分子发现周期缩短至三周以内。在亲和层析填料蛋白设计中,单轮计算测试100条序列即获得多条pM级亲和力候选分子。
奥泊生科2025年在武汉创立,由诺贝尔化学奖得主迈克·莱维特与马剑鹏等联合领衔,并在武汉产业创新发展研究院支持下成立AI蛋白质设计研究所、于光谷建设AI蛋白质设计改造产研中心。公司称其干湿结合蛋白质设计及结构解析技术可服务药物靶点发现、抗体改造、工业酶设计与创新药物研发,借助AI可在几周内计算筛选大量样本,而传统实验筛选耗时长达数年。