POLEN:可极化AMOEBA嵌入的ML/MM模拟框架
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POLEN:可极化AMOEBA嵌入的ML/MM模拟框架
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AI 综述
Cunha, Renato D 等人发布 POLEN,这是一个用于 ML/MM 模拟的 OpenMM 插件,采用相互极化的 AMOEBA 嵌入。该插件还提供一个变体:由 ML 训练头 MuPE(ML) 在每一步模拟中预测多极矩、极化率和电荷穿透。 作者称已在三个体系上测试 POLEN:水中对硝基苯胺(具有强溶剂化显色位移的推拉生色团)、含埋藏盐桥的胰蛋白酶–苯甲脒复合物,以及含卤键的 CK2α–TBB− 激酶–抑制剂复合物。这些测试结果来自作者报告,尚未见独立验证。
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最新进展11月6日 13:37
POLEN:支持相互极化 AMOEBA 嵌入的 OpenMM ML/MM 模拟框架报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月6日
- ChemRxiv Preprints精选POLEN:支持相互极化 AMOEBA 嵌入的 OpenMM ML/MM 模拟框架
作者发布 POLEN(POLarizable Embedding for Neural-network potentials),一个用于 ML/MM 模拟的 OpenMM 插件,采用相互极化的 AMOEBA 嵌入,并提供由 ML 训练头 MuPE(ML) 在每步预测多极矩、极化率和电荷穿透的变体。
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