共享隐空间PDZ结合肽设计方法提出

Yamahata等作者在bioRxiv预印本中提出一种深度学习方法：通过定量PDZ-PBM亲和力预测学习PDZ-PBM共享隐空间，并把单靶点、避脱靶和双靶点设计目标表述为该空间中的方向。 在DLG4-PDZ3单靶点重设计中，该方法给出的100个排名最高候选里有84个落入已发表突变体库实验测得互作适应度的前1%，对比方法为64个；在10残基PDM从头设计中，该方法在四个测试PDZ结构域中的三个取得最高中位计算机结合分数。作者称，避脱靶设计以降低靶结构域分数为代价，增大了各结构域内的组间分数差异；双靶点设计在两个结构域上的分数接近各自的单靶点设计。 上述结果来自预印本，尚未经过同行评议。实验验证仅涉及已发表突变体库中的单靶点重设计，其余为计算机评分。

AI 根据报道生成 · 55 分钟前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。