Ab-Affinity模型用于抗体CDR亲和力优化
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Ab-Affinity模型用于抗体CDR亲和力优化
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AI 综述
Faisal Bin Ashraf等作者提出微调蛋白语言模型Ab-Affinity，用于预测抗体对SARS-CoV-2刺突蛋白靶肽的结合亲和力，并据此优化抗体CDR设计。作者称，在留出验证集和独立测试集上，该模型优于其他基于PLM的亲和力预测器。 体外实验显示，排名最高的候选抗体相对其亲本抗体结合增强；分子对接与动力学模拟显示，最强合成候选与刺突蛋白靶表位的相互作用增强、稳定性提高。模型权重、源代码和分析流程已公开。 上述性能与结合增强来自作者报告，其中体外验证仅覆盖一个排名最高的候选。
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最新进展11月11日 08:00
Ab-Affinity：抗原特异性蛋白语言模型指导抗体CDR优化设计报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
11月11日
- PLOS Computational Biology精选Ab-Affinity：抗原特异性蛋白语言模型指导抗体CDR优化设计
【摘要级】研究提出微调蛋白语言模型Ab-Affinity，用于预测抗体对SARS-CoV-2刺突蛋白靶肽的结合亲和力，在留出验证集和独立测试集上优于其他基于PLM的亲和力预测器。
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