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AlphaFold跨膜复合物膜几何兼容性评估

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AI 综述

Sziklai等系统评估了AlphaFold蛋白质结构数据库中189,469个高置信度AlphaFold-Multimer跨膜-跨膜复合物及跨膜-可溶复合物的膜相容性。在125,657个含两个以上跨膜螺旋的可评估复合物中，95.4%的联合疏水厚度落在15–35埃的预期范围内。但部分复合物尽管预测置信度高，仍出现膜定位或原聚体取向的明显不一致；仅含一两个跨膜螺旋的跨膜蛋白相互作用常由膜外接触主导。AF3重现了有实验支持的SERCA-phospholamban相互作用，却未能重现胆固醇介导的去甲肾上腺素转运体同源二聚体。对173个含胆固醇膜蛋白靶标的基准测试显示，胆固醇结合姿态预测准确性有限，尤其是AF3训练截止后发布的结构。

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最新进展11月10日 08:00

膜几何分析揭示AlphaFold跨膜蛋白复合物预测的优势与局限

报道时间线

沿着报道，了解事件的不同侧面。

11月10日

08:00
bioRxiv · Bioinformatics精选
膜几何分析揭示AlphaFold跨膜蛋白复合物预测的优势与局限
研究系统评估了AlphaFold蛋白质结构数据库中189,469个高置信度AlphaFold-Multimer跨膜-跨膜复合物及跨膜-可溶复合物的膜相容性。在125,657个可评估复合物中，95.4%的联合疏水厚度落在15-35埃的预期范围内，但部分复合物尽管预测置信度高，仍出现膜定位或原聚体取向的明显不一致，仅含一两个跨膜螺旋的相互作用常由膜外接触主导。

本事件热度走势

可比范围当前: 5
可比范围峰值: 811月11日 07:00
近 24 小时变化: -21%

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