bioRxiv · Bioinformatics· Sziklai, D., Wiener, Z., Padanyi, R., Hegedus, T. ·· 4 天前精选AI 评分67
膜几何分析揭示AlphaFold跨膜蛋白复合物预测的优势与局限
Membrane Geometry Reveals Strengths and Limitations of AlphaFold-Predicted Transmembrane Protein Complexes
AI 导读
研究系统评估了AlphaFold蛋白质结构数据库中189,469个高置信度AlphaFold-Multimer跨膜-跨膜复合物及跨膜-可溶复合物的膜相容性。在125,657个可评估复合物中，95.4%的联合疏水厚度落在15-35埃的预期范围内，但部分复合物尽管预测置信度高，仍出现膜定位或原聚体取向的明显不一致，仅含一两个跨膜螺旋的相互作用常由膜外接触主导。
推荐理由
研究用膜几何约束系统检验AlphaFold跨膜复合物预测，为置信度之外的合理性评估提供参照。
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