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自博弈MCTS优化抗菌肽,16条中3条体外抑菌

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AI 综述

Jang-Jih Lu等作者在《Briefings in Bioinformatics》发表研究,提出代理引导自博弈蒙特卡洛树搜索的强化学习框架,结合抗菌活性预测、HemoDL预测的溶血倾向与ESMFold结构置信度,对抗菌肽序列做多性质优化。 作者合成16条候选肽,用琼脂稀释法在0.25–64 μg/ml浓度下对37株细菌测试,其中AMP2、AMP7、AMP9能完全抑制至少一株受试菌,占16条中的3条(18.75%)。实验只测了细菌琼脂稀释活性,未做哺乳动物细胞毒性、湿实验溶血和肽稳定性检测。 作者称,不同菌株的结果显示,替代模型、对接和结构评分不能完全反映抗菌效果的全部决定因素。

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沿着报道,了解事件的不同侧面。

11月13日
  1. Briefings in Bioinformatics精选
    代理引导自博弈蒙特卡洛树搜索优化抗菌肽并在体外评估抑菌活性

    【摘要级】研究提出代理引导自博弈蒙特卡洛树搜索的强化学习框架,结合抗菌活性预测、HemoDL预测的溶血倾向与ESMFold结构置信度对抗菌肽序列做多性质优化。

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