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ATMOS:状态空间模型生成原子级分子轨迹

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AI 综述

Liang Shi 等作者提出 ATMOS,一个基于状态空间模型的生成框架,用于生成生物分子的原子级分子动力学轨迹。该方法用基于 Pairformer 的状态转移机制捕捉时间依赖,并用扩散模块解码轨迹帧。 作者报告,ATMOS 在蛋白质单体和蛋白-配体体系的构象轨迹生成上达到当前最优性能。该工作已被 NeurIPS 2026 接收,作者将其定位为迈向动力学基础模型的一步。

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11月9日
  1. arXiv · q-bio.BM (生物大分子)精选
    ATMOS:用状态空间模型生成生物分子原子级动力学轨迹

    研究提出 ATMOS,一个基于状态空间模型(SSM)的生成框架,用于生成生物分子的原子级分子动力学轨迹。该方法结合基于 Pairformer 的状态转移机制捕捉时间依赖,并用扩散模块解码轨迹帧,作者报告其在蛋白质单体和蛋白-配体体系的构象轨迹生成上达到当前最优性能。该工作已被 NeurIPS 2026 接收,定位为迈向动力学基础模型的一步。

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