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AtomLM-9b：全原子分词器预测结构

2 篇报道2 个报道来源5 天前更新

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AI 综述

研究团队（Yan, J. 等作者）发布预印本，提出将生物分子几何压缩为离散结构 token 的全原子结构分词器，并据此训练结构预测模型 AtomLM-9b。团队称，该分词器在 CASP14 和 CASP15 上的全原子 lDDT 分别为 0.832 和 0.835。 在 FoldBench 蛋白质-蛋白质任务上，团队报告 AtomLM-9b 成功率为 75.01%，并对比已发表的 AlphaFold 3 结果 72.93%。上述性能均为作者在预印本中的报告，尚未经同行评审确认。

AI 根据报道生成 · 4 天前更新

最新进展11月4日 08:00
AtomLM-9b：全原子结构分词器驱动的生物分子结构预测模型

报道时间线

沿着报道，了解事件的不同侧面。

11月5日
  1. 下一分子
    AI制药日报｜大分子/小分子/虚拟细胞多项研究进展

    研究团队用肽条形码、尺寸排阻色谱与质谱结合的混合方法，在大肠杆菌统一生产条件下量化了超过39000个天然蛋白结构域变体、从头设计蛋白和纳米抗体的单体产量。AtomLM-9b以全原子结构分词器将生物分子几何压缩为离散结构token，在CASP14和CASP15上全原子lDDT分别为0.832和0.835。单细胞基础模型基准评测显示，五种模型在跨物种注释与扰动预测上优于简单基线，但同物种内优势有限。

11月4日
  1. bioRxiv · Bioinformatics精选
    AtomLM-9b：全原子结构分词器驱动的生物分子结构预测模型

    研究团队开发全原子结构分词器，将生物分子几何压缩为离散结构 token，在 CASP14 和 CASP15 上全原子 lDDT 分别为 0.832 和 0.835。

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