bioRxiv · Bioinformatics· Yan, J., Xie, D., Wang, Z., Xu, M., Zhang, Z. ·2026-11-04 08:00· 5 天前精选AI 评分76

AtomLM-9b：全原子结构分词器驱动的生物分子结构预测模型

All-Atom Structure Tokenizer: AtomLM-9b for Biomolecular Structure Prediction

AI 导读

研究团队开发全原子结构分词器，将生物分子几何压缩为离散结构 token，在 CASP14 和 CASP15 上全原子 lDDT 分别为 0.832 和 0.835。

推荐理由

预印本提出全原子结构分词器并据此训练语言模型，在FoldBench蛋白-蛋白任务上给出与AlphaFold 3可比的对照结果。