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Neopep:MLFF能量强化学习预测非天然肽结构

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AI 综述

Jagannathan 与 Kim 在 bioRxiv 预印发表 Neopep,一个以序列为条件的扩散模型,用于预测含非天然氨基酸(ncAA)多肽的结构。模型先在 PDB 结构上预训练建立结构先验,再用冻结的机器学习力场(MLFF)对模型生成的结构打分,并将该能量信号回传以微调模型。 作者称,Neopep 生成的含 ncAA 多肽结构与真实结构的平均 RMSD 低于未经微调的版本及其他现有结构预测方法。模型训练时使用固定的 189 种 ncAA,但作者称其架构在原子层面运作,原则上可推广到任意化学结构。

AI 根据报道生成 · 11 天前更新

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10月28日
  1. bioRxiv · Bioinformatics精选
    Neopep:用机器学习力场能量强化学习预测非天然氨基酸多肽结构

    作者提出 Neopep,一个以序列为条件的扩散模型,用于含非天然氨基酸(ncAA)多肽的结构预测:先在 PDB 结构上预训练建立结构先验,再用冻结的机器学习力场(MLFF)对模型提出的结构打分,并将该能量信号回传以微调模型。

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