SV-Hop：无对接接触守恒骨架跃迁基准发布

研究团队发布 SV-Hop 骨架跃迁基准与方法：从蛋白质数据库构建 2886 对结合同一口袋但 Bemis–Murcko 骨架不同的配体对，覆盖 27 个靶点、五个家族，并公开基准、词典、模型和 22 化合物前瞻面板。 作者提出无对接的接触保持判据，称真实跃迁在 40 对晶体中恢复 80.6% 的参考接触，97% 的配体对超过 0.6；该判据与药效团重叠相关（ρ=0.51，n=50），但与效力差距不相关（ρ=−0.13），作者说明它衡量构象而非亲和力。 基准的骨架留出划分保留骨架而非口袋，97.4% 的测试配体对与训练集共享口袋；在靶点迁移下增益降至 +5.3 个百分点（65.3% 对 60.0%），排序模型迁移较弱（ρ=0.13）。

AI 根据报道生成 · 3 天前更新