ESMfluc预测蛋白骨架局部变异性并解析证据
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ESMfluc预测蛋白骨架局部变异性并解析证据
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AI 综述
Tran等作者开发了ESMfluc，用ESM2或ESM3蛋白语言模型表示预测蛋白质局部主链可变性，并分解注意力以定位支持或反对预测的序列位置。模型在ATLAS分子动力学模拟上训练，用于区分只采样单一Protein Block状态的残基与采样多个状态的残基。 在208个留出ATLAS蛋白上，七种模型条件中最佳的微调ESM3模型达到AUROC 0.889；在985个经序列相似性过滤的mdCATH结构域中（排除每条链两端各两个残基），其域内Spearman相关均值为0.616，高于最强外部预测器PEGASUS的0.589。 不过作者报告，在均方根涨落这一指标上，若干外部预测器与实验值的一致性优于ESMfluc。
AI 根据报道生成 · 11 天前更新
最新进展10月28日 08:00
ESMfluc 追踪蛋白语言模型预测主链可变性的证据来源报道时间线
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10月28日
- bioRxiv · Biophysics精选ESMfluc 追踪蛋白语言模型预测主链可变性的证据来源
研究提出 ESMfluc，基于 ESM2 或 ESM3 表示预测蛋白质局部主链可变性，并分解注意力以定位支持或反对预测的序列位置。在 208 个留出 ATLAS 蛋白上，微调 ESM3 模型达到 AUROC 0.889；在 985 个 mdCATH 结构域中，其域内 Spearman 相关均值为 0.616，高于最强外部预测器 PEGASUS 的 0.589。
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