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bioRxiv · Biophysics· Tran, N. K. N., Rife, T., Korpusik, M., Alavi, Z. ·· 12 天前精选AI 评分68

ESMfluc 追踪蛋白语言模型预测主链可变性的证据来源

Who contributes to whom: following the evidence behind protein language-model predictions of backbone variability

AI 导读

研究提出 ESMfluc,基于 ESM2 或 ESM3 表示预测蛋白质局部主链可变性,并分解注意力以定位支持或反对预测的序列位置。在 208 个留出 ATLAS 蛋白上,微调 ESM3 模型达到 AUROC 0.889;在 985 个 mdCATH 结构域中,其域内 Spearman 相关均值为 0.616,高于最强外部预测器 PEGASUS 的 0.589。

推荐理由

研究用注意力分解追踪蛋白语言模型判断主链可变性的证据来源,为模型可解释性提供可迁移方法。

来源:bioRxiv · Biophysics · biorxiv.org