基于 ProteinMPNN 架构与 CyclicPepedia 数据的多肽设计探索：v6 实验版模型

个人开发者参考 ProteinMPNN 编码器-解码器框架，用 CyclicPepedia 环肽结构数据经 150 轮迭代独立训练出聚焦多肽的 v6 实验版模型。引入位置编码并增至 6 层 GCN 后，模型在内部验证集上的序列恢复率从约 23.3% 提升至 46.7%。该模型已部署为在线 Demo，可上传多肽 PDB 骨架获取序列设计建议，但仅处实验探索阶段，指标仅代表内部测试表现。