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bioRxiv · Bioinformatics· Stamenov, M., Gjurovska, M., Vodilovska, V., Ivanoska, I. ·· 10 天前精选AI 评分63

GNN与预训练模型在ADMET预测中的任务依赖表现:统一调参预算下的基准评测

Task-Dependent Performance of GNNs and Pretrained Models in ADMET Prediction

AI 导读

该预印本在六个TDC ADMET终点、骨架划分下比较GNN、冻结预训练模型(ChemBERTa、MolCLR)与指纹基线,并给每个模型家族相同的50次试验、按验证集选参的调参预算,报告10个随机种子的中位数。

推荐理由

在统一调参预算与骨架划分下比较GNN、预训练模型和指纹基线,为ADMET模型选择提供参照。

来源:bioRxiv · Bioinformatics · biorxiv.org