arXiv · q-bio.BM (生物大分子)· Alexander Arjun Lobo, Marc Saouda, Urvi Awasthi, Leonid Zhukov·· 2 天前精选AI 评分60
PeptSol:面向药物生产中受保护肽溶解度的转化基准
PeptSol: A Translational Benchmark for Protected-Peptide Solubility in Drug Manufacturing
AI 导读
作者提出PeptSol,一个包含1388条人工整理的受保护肽溶解度测量数据的开放基准,采用化学感知的数据划分。数据仅覆盖84条母体序列和101种受保护结构,92.5%来自单一历史项目;在七个冻结分子编码器上,历史子集在肽留出划分下的二分类溶解度最佳macro-F1为0.843,更难的三分类序数任务在该单元格为0.614,且没有基础模型能稳定优于化学指纹加显式分子描述符的基线。
推荐理由
该基准用1388条受保护肽溶解度数据评测七种分子编码器,为合成相关肽可开发性预测提供参照。
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