跳到正文
ChemRxiv Preprints· Lukauskis, Dominykas·· 10 天前精选AI 评分69

SandCat:用于前瞻性隐藏口袋发现的 OpenMM 框架

SandCat: OpenMM Framework for Prospective Cryptic Pocket Discovery

AI 导读

作者发布基于 OpenMM 的 SandCat 工具包,实现用于隐藏口袋发现的增强采样方法,计算速度达到 SWISH-X 的两倍并复现其既往结果。该工具还提供在未知隐藏口袋靶点上前瞻性使用的标准化流程,在多个挑战性靶点上所有已表征隐藏位点均进入前六候选位点,阴性对照未检出位点。上述结果来自预印本摘要,仅涉及计算预测。

推荐理由

该工具把增强采样方法移植到 OpenMM,速度提升并给出前瞻性发现隐藏口袋的流程,便于评估其可复用性。

来源:ChemRxiv Preprints · chemrxiv.org