bioRxiv · Bioinformatics· Ghajari, G., Thirunarayan, K., Amsaad, F. ·2026-11-06 08:00· 3 天前精选AI 评分69

研究揭示单细胞扰动筛选中的孔板设计混杂供体差异与模型评测

Plate design confounds donor variation and model evaluation in single-cell perturbation screens

AI 导读

该预印本基于90种细胞因子筛选、两项化合物筛选、四个队列与模拟，指出孔板孔位效应解释了丰度较高细胞类型中大部分重复对照变异，对照孔携带共同偏移，相同对照孔在标准阈值下差异表达基因可达数百个，数量约与两种受体阴性蛋白相当。

推荐理由

研究用多队列单细胞筛选与模拟说明孔板布局会混淆供体差异，并给出设计感知的模型评测参照。