bioRxiv · Bioinformatics· Hashemi Aghdam, H., Shukueian Tabrizi, S., Cicek, A. E. ·· 3 天前精选AI 评分72
RPFace:从有偏结构基准到可泛化的RNA-蛋白界面预测
RPFace: From biased structural benchmarks to generalizable RNA-protein interface prediction
AI 导读
研究构建并发布了一个按结构与实验条件分层的蛋白-RNA公平基准,发现共折叠方法检测结合位点的准确性集中在核糖体复合物并随实验模态系统变化,对接方法仅在输入构象接近结合态时可靠,两类方法均无法迁移到体内CLIP实验。
推荐理由
研究构建分层蛋白-RNA基准,揭示共折叠与对接方法在体内CLIP数据上的迁移局限,并提出仅用序列的界面预测模型。
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