PLOS Computational Biology· Maugé Y, Ventre E.·2026-10-06 08:00· 2026-10-06精选AI 评分68

CardamomOT：基于机制最优传输的基因调控网络推断与轨迹重建框架

CardamomOT: A mechanistic optimal transport-based framework for gene regulatory network inference, trajectory reconstruction and generative modeling.

AI 导读

【全文节选总结】作者提出CardamomOT，在机制最优传输框架下从时序scRNA-seq快照联合推断基因调控网络与隐藏蛋白轨迹，并校准为可生成数据、模拟基因敲除与过表达的生成模型。

推荐理由

该方法把GRN驱动的机制模型嵌入最优传输，用时间序列快照联合重建蛋白轨迹与调控网络，并给出可模拟扰动的生成模型。