Nature Chemical Biology· Rachel E. Hayward, Raymond F. Berkeley, Zijian Gao, Maximilian Garhammer, Marc A. Morizono, Evert Njomen, Haoxin Li, Kristen E. DeMeester, Victor Cociorva, Mark A. Herzik, F. Ulrich Hartl, Bruno Melillo, Benjamin F. Cravatt·· 24 天前精选AI 评分74
实验评测揭示 Boltz-2、AlphaFold3 对非正构共价配体位点的预测盲区
Tryptoline stereoprobe elaboration identifies inhibitors of the GRPEL1–HSPA9 complex
AI 导读
【全文节选总结】研究将化学蛋白组学测得的立体探针结合位点与共折叠预测比较,发现 Boltz-2、AlphaFold3 常把非正构配体误放到正构口袋。共价建模或位点约束也未充分解决实验观察到的立体选择性。这项工作的重要性在于揭示计算药研模型的适用局限,而非仅发现 GRPEL1–HSPA9 抑制剂。
推荐理由
研究用共价配体图谱检验Boltz-2对非正构位点的定位能力,为共折叠模型评测提供参照。
来源:Nature Chemical Biology · nature.com