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ChemRxiv Preprints· Lee, Euihyun·· 3 天前精选AI 评分63

LigandFF:基于公开算法开源复现CGenFF原子分型与参数分配

LigandFF: an open-source implementation of rule-based atom typing, charge assignment and parameter assignment by analogy

AI 导读

LigandFF 依据已发表的算法和公开的 CGenFF 5.0 拓扑、参数与电荷增量文件,开源复现了 CGenFF 的原子分型、键电荷增量赋电荷与类比参数迁移流程,可输出 CHARMM stream、PSF 及 OpenMM、GROMACS 输入。

推荐理由

开源复现CGenFF的原子分型与参数类比流程,并给出与官方程序在留出集上的逐项对照。

来源:ChemRxiv Preprints · chemrxiv.org