ChemRxiv Preprints· Lee, Euihyun·· 3 天前精选AI 评分63
LigandFF:基于公开算法开源复现CGenFF原子分型与参数分配
LigandFF: an open-source implementation of rule-based atom typing, charge assignment and parameter assignment by analogy
AI 导读
LigandFF 依据已发表的算法和公开的 CGenFF 5.0 拓扑、参数与电荷增量文件,开源复现了 CGenFF 的原子分型、键电荷增量赋电荷与类比参数迁移流程,可输出 CHARMM stream、PSF 及 OpenMM、GROMACS 输入。
推荐理由
开源复现CGenFF的原子分型与参数类比流程,并给出与官方程序在留出集上的逐项对照。
来源:ChemRxiv Preprints · chemrxiv.org