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arXiv · q-bio.BM (生物大分子)· Zhou Zhang, Hanqun Cao, Minghao Sun, Odin Zhang, Yang Zhang, Pheng Ann Heng, Wujun Li, Tianfan Fu·· 17 天前精选AI 评分63

RiboBridge:以蛋白为条件的从头RNA结合剂结构设计框架

RiboBridge: protein-conditioned de novo RNA binder structure design

AI 导读

RiboBridge是一个以结构为先的从头RNA结合剂设计框架,将RNA构象生成与蛋白- RNA组装分离:先在蛋白表面提出多个候选RNA结合界面,在预训练RNA结构隐空间RiboSphere内生成规范RNA构象,再预测蛋白- RNA相互作用约束,通过刚性放置得到几何一致的蛋白相对位姿。

推荐理由

该框架把RNA构象生成与蛋白- RNA组装拆开,在124个复合物基准上比较了界面恢复精度。

来源:arXiv · q-bio.BM (生物大分子) · arxiv.org