bioRxiv · Bioinformatics· Lei, Y., Liang, H., Peng, K., Wen, J. ·· 3 天前精选AI 评分69
UnDetect:通过上下文建模与多视图迁移预测未见化合物的转录响应
Predicting Transcriptional Responses to Unseen Compounds through Context Modeling and Multi-View Transfer
AI 导读
研究提出 UnDetect 框架,将细胞与实验背景变异同化合物效应分离,以预测未做过转录谱分析的化合物的转录响应。作者报告,在药物盲法 L1000 基准上,从七个已发表模型中移除药物输入后,准确率变化最多为 0.012 Pearson 相关;UnDetect 是唯一在每一折都超过忽略化合物输入的网络的模型,在板内评分上达到 0.117,而最强已发表模型为 0.092。
推荐理由
研究指出既有模型几乎不利用化合物信息,并提出分离背景与化合物效应的框架,为扰动图谱的评测提供参照。
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