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bioRxiv · Biophysics· Mendez-Otalvaro, E., de Groot, B. ·· 26 天前精选AI 评分58

K2P通道调节口袋的化学扰动扫描识别亲和力热点

A chemical perturbation scan on a K2P channel modulator pocket identifies affinity hotspots

AI 导读

研究对TREK1通道激活剂ML335进行46个化学取代,用非平衡炼金术自由能计算评估其与调节口袋上下区域的结合变化。结果显示响应高度不对称:下环取代削弱结合,可追溯到连接M3、P2、P1螺旋与选择性过滤器的π-π堆叠网络;上环取代被耐受并改变与Cap-P1、SF2-M4环及上部选择性过滤器的接触。

推荐理由

研究用46个化学取代扫描TREK1调节口袋,区分上下口袋对结合的贡献并关联门控残基。

来源:bioRxiv · Biophysics · biorxiv.org