arXiv · q-bio.BM (生物大分子)· Xinyan Zhao, Yi-Ching Tang, Victor J Cantu, Junseok Lee, Adam E Stogsdill, Ibraheem M Hamdi, Ashwin Kumar Ramesh, Zhiqiang An, Xiaoqian Jiang, Yejin Kim·· 5 天前精选AI 评分74
AbBiBench:抗体-抗原结合亲和力计算模型综合基准
A Comprehensive Benchmark of Computational Models for Antibody--Antigen Binding Affinity
AI 导读
研究提出AbBiBench,以抗体-抗原复合物为评测单元,整合13种抗体、9种抗原的216,560条实验测量,在无任务特定训练或微调下比较20种计算方法。结果显示全局结构条件逆折叠给出最强且最一致的亲和力排序,抗体特异性微调未带来一致提升,模型排序更利于筛选潜在亲和力提升而非排除弱变体。
推荐理由
该基准以抗体-抗原复合物为评测单元,比较20种方法在亲和力排序上的表现,为功能导向的抗体设计评测提供参照。
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