bioRxiv · Bioinformatics· Babu, D., Pandurangan, S., Agilisium Consulting ·· 19 天前精选AI 评分58
研究用冻结ESM2与结构残基先验从序列预测HER2纳米抗体表位与互补位
Sequence-only prediction of VHH nanobody epitopes and paratopes on HER2 with a frozen protein language model ( ESM2) and a structure-derived residue prior
AI 导读
该预印本提出仅用序列预测HER2表位与VHH纳米抗体互补位，全程不做三维结构预测，以冻结的ESM2 650M作特征提取器，配12.2M可训练参数的链编码器、共享交叉注意力模块及表位、互补位、结合剂三个头，在AVIDa hHER2竞争实验、SAbDab2残基接触和两个参考抗体晶体结构上联合训练。
推荐理由
研究用冻结ESM2与结构先验做纯序列表位预测，并如实报告新抗原残基级结果接近基线。
来源：bioRxiv · Bioinformatics · biorxiv.org