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arXiv · q-bio.BM (生物大分子)· Jun W. Kim, Artiom Myaskovsky, Oscar Donosa, Lawrence Chan, Jamie Rogers, Avinatan Hassidim, Yossi Matias, Annalisa Pawlosky·· 13 天前同新闻AI 评分74

表位截短结合智能体搜索加速从头结合剂设计

Agent-guided epitope excision enables economical de novo binder design

AI 导读

研究提出表位截短方法,将靶点截为局部界面窗口以加速骨架扩散与结构预测,在15个靶点、3666个设计中截短窗口与全靶点结合界面的中位Cα RMSD为0.37 Å,并在FAP的719残基胞外域上使RFdiffusion与AlphaFold3的GPU时间在一个表位中减少约88%。

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来源:arXiv · q-bio.BM (生物大分子) · arxiv.org