细胞图谱能白嫖,唯独扰动数据,必须自己攒
单细胞表征数据已成公共品,CZ CELLxGENE 的 Census 构建版收录2.18亿个细胞,可免费训练细胞基座模型;但扰动配对数据因单细胞测序的破坏性、公共扰动库浅或小、组合空间巨大而必须自采。Recursion 内部 RPI-93M 含9276万张显微图像、覆盖395.7万个扰动,其开源的 RxRx3 不到内部数据1%;Insitro 与 Xaira 同样以自建湿实验生产配对数据。
单细胞表征数据已成公共品,CZ CELLxGENE 的 Census 构建版收录2.18亿个细胞,可免费训练细胞基座模型;但扰动配对数据因单细胞测序的破坏性、公共扰动库浅或小、组合空间巨大而必须自采。Recursion 内部 RPI-93M 含9276万张显微图像、覆盖395.7万个扰动,其开源的 RxRx3 不到内部数据1%;Insitro 与 Xaira 同样以自建湿实验生产配对数据。
Turbine 发布 Virtual Biology Meetup 第三期完整回放,该期于9月15日围绕虚拟检测如何赢得真实研发决策信任展开。Xaira 的 Ci Chu 介绍大规模扰动数据集如何训练虚拟细胞模型应对未见过的生物学场景,Turbine 的 Krishna Bulusu 则讨论从“能否预测”转向“能否改变决策”。