MolRSI:自进化分子发现智能体以跨任务经验优化工作流,抗菌筛选命中率15.9%
东北大学、Broad研究所等机构在arXiv预印本中提出自进化分子发现智能体MolRSI,把模型选择与组件组合等工作流作为优化对象,并用跨任务记忆积累可复用经验。
推荐理由:研究把分子发现工作流本身作为优化对象,并用抗菌筛选与pMHC结合蛋白两条湿实验路线检验其产出。
东北大学、Broad研究所等机构在arXiv预印本中提出自进化分子发现智能体MolRSI,把模型选择与组件组合等工作流作为优化对象,并用跨任务记忆积累可复用经验。
推荐理由:研究把分子发现工作流本身作为优化对象,并用抗菌筛选与pMHC结合蛋白两条湿实验路线检验其产出。
“长江杯”全球AI蛋白质设计挑战赛于2026年11月1日公布七大靶点与竞赛规则,计划对每个赛道1000条、合计约7000条AI从头设计的候选蛋白序列统一做表达、纯化和亲和力检测,并按实测KD排名。
Brian Hie 团队报告 Evo 2 在仅给四个示例、不做额外训练时可生成金属结合蛋白、从头抗体与完整噬菌体基因组,作者称其为训练时未预料到的生成式上下文学习。
作者逐行核对 Mol-1 的宣传数据与 GitHub 仓库,发现 FoldBench-AB 75.0% 有出处但对比的 IsoDDE 与 75.58% 无法对应,所谓“8 项里胜过 Anthropic 10 项”算术不通,且 Mol-1 实为 Protenix 衍生模型。
罗氏及旗下Prescient Design团队发布论文,推出从美国专利提取的抗体数据集POISK,含10,110件专利、89,074条抗体–抗原记录、78,174条独特抗体和2,069个独特靶点序列,并提供亲和力、表位残基与竞争关系等36类字段。
“长江杯”全球AI蛋白质设计挑战赛报名队伍已突破1200支,覆盖16个国家和地区,总奖金加码至140万元人民币、免费湿实验验证扩容至7000条。序列提交与报名截止日期由11月15日延长至11月30日,靶点将于11月1日一次性公布。大赛以真实湿实验数据为唯一评价标准,每队每赛道最多提交20条从头设计序列。
截至2026-10-16,David Baker团队今年在《Nature》和《Science》正刊发表9篇论文(含1篇综述),覆盖人工酶从头设计、靶向GPCR与Ras的结合蛋白、蛋白质纳米笼、荧光团结合蛋白及膜蛋白结构解析工具。其中Science论文报道RFdiffusion3可在生物大分子中直接构建原子级精度的功能位点支架,Nature论文则实现半胱氨酸蛋白酶与金属蛋白酶的从头设计。
Prescient Design 提出 MIMOSA,在推断阶段把靶点已知结合物的界面几何与残基性质作为约束喂给扩散过程,不重训练模型,可直接套用于 RFAntibody 和 BoltzGen。
推荐理由:汇总多条预印本与工具更新,其中抗体推断时约束方法附湿实验命中率,便于比较难靶点设计思路。
英灵殿科技团队提出EpiBench,一个面向抗体药物发现的表位推理基准,包含1,609个样本和五项相互关联任务,标签来自抗体–抗原复合物结构、功能性B细胞实验与深度突变扫描数据。
推荐理由:该基准把表位理解拆成五项抗体发现决策任务,并给出通用大模型在长序列定位与抗体特异性对应上的具体缺口。
【摘要级】LabGenius 提出 3in1 噬菌体展示生物淘选方法,采用非变性洗脱并跳过中间噬菌体扩增步骤,在一天内完成全部淘选轮次。作者称该方法比传统淘选快五倍,获得的独特命中化合物最多多六倍且亲和力范围较广,并将先导化合物发现时间缩短一周、减少耗材与废弃物。该方法在针对多种靶点的天然合成库和免疫库中展示适用性,材料仅为论文摘要。
推荐理由:该方法把多轮噬菌体展示筛选压缩到一天,并报告了命中多样性与亲和力范围的对照结果。